Autogeenimylly on mylly, jossa malmi jauhaa itse itseään. Jauhinkappaleina käytetään isompia malmilohkareita. Tätä varten erotellaan jo murskausvaiheessa isompia malmilohkareita ja keskikokoisia malmikappaleita (niin kutsutut palat) malmimurskeesta. Keretissä oli siilot erikseen lohkareille ja paloille.

Autogeenimyllyn jauhaminen perustuu siihen, että malmikappaleet hioutuvat toisiaan vasten, siinä missä tanko- ja kuulamyllyt jauhavat malmia pääasiallisesti tiputtamalla jauhinkappaleet sen päälle. Vähemmässä määrin myös autogeenimyllyssä tapahtuu jauhaminen tiputtamalla jauhinkappaleet malmin päälle.